细菌、真菌转录组测序和互作转录组测序
产品说明:通过转录组测序,研究细菌在某个特定的培养时间或某种处理条件下表达出来的所有mRNA和sRNA,通过实验组和对照组的比较分析,获得相同条件下差异表达的基因,从而探究响应某种处理或表型相关的基因。服务说明:个性化研究方案设计——专业的信息分析—
产品说明:通过转录组测序,研究细菌在某个特定的培养时间或某种处理条件下表达出来的所有mRNA和sRNA,通过实验组和对照组的比较分析,获得相同条件下差异表达的基因,从而探究响应某种处理或表型相关的基因。
服务说明:个性化研究方案设计——专业的信息分析——深入、系统的数据挖掘
数据的价值在于真正解决科学问题,割裂式的分析再多也是徒劳,我们针对您的研究课题,基于大量的调研和探讨,一对一制定科学问题的解决方案,并执行实施,深入系统的挖掘数据,解决科学点。
产品 |
测序策略 |
适用方向 |
原核普通转录组 |
普通转录组文库 |
主要针对mRNA的分析 |
原核连特异性转录组 |
链特异性转录组文库 |
针对mRNA和sRNA的分析 |
分析项目
分析类型 |
分析项目 |
分析类型 |
分析项目 |
基因表达分析 |
原始数据质控与统计 |
基因结构分析 |
全基因组操纵子分析 |
与参考基因组比对 |
转录起始位点与终止位点预测 |
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rRNA残留率评估 |
启动子序列预测 |
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测序饱和度分析 |
5’和3’ UTR注释及相关长度分析 |
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基因和基因组覆盖度分析 |
SD(Shine-Dalgarno)序列预测 |
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冗余序列分析 |
Rho-independent terminator序列预测 |
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样本间相关性评估 |
sRNA预测和长度分布 |
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基因表达量分析 |
sRNA注释 |
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差异基因表达分析 |
sRNA二级结构预测 |
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差异基因Venn图 |
sRNA靶基因预测 |
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差异基因GO分类统计与富集分析 |
sRNA靶基因GO显著性分析 |
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差异基因KEGG分析和通路富集 |
sRNA靶基因KEGG显著性分析 |
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数据上传 |
NCBI数据上传(原始数据上传) |
其他 |
个性化数据挖掘、绘图 |