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细菌、真菌转录组测序和互作转录组测序

产品说明:通过转录组测序,研究细菌在某个特定的培养时间或某种处理条件下表达出来的所有mRNA和sRNA,通过实验组和对照组的比较分析,获得相同条件下差异表达的基因,从而探究响应某种处理或表型相关的基因。服务说明:个性化研究方案设计——专业的信息分析—

产品说明通过转录组测序,研究细菌在某个特定的培养时间或某种处理条件下表达出来的所有mRNA和sRNA,通过实验组和对照组的比较分析,获得相同条件下差异表达的基因,从而探究响应某种处理或表型相关的基因。

服务说明:个性化研究方案设计——专业的信息分析——深入、系统的数据挖掘

 数据的价值在于真正解决科学问题,割裂式的分析再多也是徒劳,我们针对您的研究课题,基于大量的调研和探讨,一对一制定科学问题的解决方案,并执行实施,深入系统的挖掘数据,解决科学点。

产品

测序策略

适用方向

原核普通转录组

普通转录组文库

主要针对mRNA的分析

原核连特异性转录组

链特异性转录组文库

针对mRNA和sRNA的分析

分析项目

分析类型

分析项目

分析类型

分析项目

基因表达分析

原始数据质控与统计

基因结构分析

全基因组操纵子分析

与参考基因组比对

转录起始位点与终止位点预测

rRNA残留率评估

启动子序列预测

测序饱和度分析

5’和3’ UTR注释及相关长度分析

基因和基因组覆盖度分析

SD(Shine-Dalgarno)序列预测

冗余序列分析

Rho-independent terminator序列预测

样本间相关性评估

sRNA预测和长度分布

基因表达量分析

sRNA注释

差异基因表达分析

sRNA二级结构预测

差异基因Venn图

sRNA靶基因预测

差异基因GO分类统计与富集分析

sRNA靶基因GO显著性分析

差异基因KEGG分析和通路富集

sRNA靶基因KEGG显著性分析

数据上传

NCBI数据上传(原始数据上传)

其他

个性化数据挖掘、绘图

 

 

  • 操作系统:EMUI 4.1 + Android 6.0
  • 用户界面:EMUI 4.1
  • 键盘类型:虚拟键盘
  • 产品型号:EDI-AL10
  • 机身内存:64GB

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