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【课程】微生物基因组生信分析必学系列

课程目录微生物基因组发表就必定离不开基因组文件上传到公共数据库,比如最核心的NCBI数据库,细菌、真菌、质粒、病毒等,上传方法有什么异同?经常会有什么问题?如何解决?这些内容,都将在我们的课程中获得答案。第一节:微基因组上传NCBI必答要点1、上传方式的区别与差异2、上传过程中常遇到的问题3、上传流程和材料准备4、经验分享和建议系统发育树分析,是比较基因组研究中永远绕不可的专题,常用的进化树有哪些

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课程链接:http://college.mimazi.net/course/article-39.html


课程目录

微生物基因组发表就必定离不开基因组文件上传到公共数据库,比如最核心的NCBI数据库,细菌、真菌、质粒、病毒等,上传方法有什么异同?经常会有什么问题?如何解决?这些内容,都将在我们的课程中获得答案。

第一节:微基因组上传NCBI必答要点

1、上传方式的区别与差异

2、上传过程中常遇到的问题

3、上传流程和材料准备

4、经验分享和建议

系统发育树分析,是比较基因组研究中永远绕不可的专题,常用的进化树有哪些种?进化树的类型和展示方式代表着什么生物学意义?针对于不同的科研目的和样本材料,又该如何选择不同的算法构建进化树?这些内容,都将在我们的课程中解答。


第二节:微生物进化树结构必学要点

1、常见进化树类型

2、常见进化树软件的算法

3、进化树结果解读

4、经验分享和建议

微生物适应环境以及获得新的生物学功能,很重要的一个途径就是通过水平转移的方式获得新的基因或者整套元件系统,而移动元件在基因转移与传播过程中发挥着决定性作用。常见的移动元件有哪些?常用的生信分析方法有哪些?移动元件介导下的基因转移背后的生物学意义是怎样的?专业知识,将在我们的课程中逐一解答。


第三节:微生物移动元件分析必学要点

1、常见的移动元件类型

2、移动元件的研究方法

3、典型案例的解读

4、研究方法和经验分享

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【课程】微生物基因组生信分析必学系列(图1)



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