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植物叶绿体基因组信息分析

分析类型分析项目目的基因组组装基因组评估及基因组组装获得高质量基因组序列基因组组分研究mRNA、rRNA、tRNA预测分析获得编码/非编码基因序列Nr注释、KEGG注释、COG注释获得编码基因的功能描述基因组和CDS碱基组成分析碱基偏好性分析密码子使

分析类型

分析项目

目的

基因组组装

基因组评估及基因组组装

获得高质量基因组序列

基因组组分研究

mRNA、rRNA、tRNA预测

分析获得编码/非编码基因序列

Nr注释KEGG注释COG注释

获得编码基因的功能描述

基因组和CDS碱基组成分析

碱基偏好性分析

密码子使用偏好性分析

密码子偏好性分析

SSR分析

获得基因组SSR序列

重复序列预测与分析

获得重复序列信息

基因组结构研究

gbk文件生成

获得GBK文件

基因组圈图

基因组图示化展示

IR区扩张收缩分析

分析基因组四部分序列的变异情况

比较基因组分析

比较基因组圈图

比较两个或多个基因组结构的差异

进化树构建

获得系统进化树

共线性分析

比较两个或多个基因组结构变异

SNP/InDel分析

获得基因组点突变信息

NCBI数据上传

上传含注释结果的基因组

基因组上传NCBI

其他个性化分析

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