【课程】微生物测序数据和基因组数据上传NCBI实操

本套课程已上传至密码子学院平台，点击如下链接学习课程：

https://college.mimazi.net/course/article-58.html

导语：

微生物基因组研究，获得的菌鉴数据、测序原始数据和基因组组装与注释数据，都绕不开要要把数据共享和上传到公共数据库，不同类型数据该如何选择性释放？释放时间该如何确认？上次过程中经常会有什么问题以及该如何解决？在我们的奔逃专题课程中将为您剖析解答。

课程简介：

本套课程是由上海唯那生物技术团队结合多年的项目分析实战经验，结合着诸多科研客户遇到的各类需求和实践中遇到的各类问题综合开发出来的。课程聚焦于解决实际问题，可操作性强，学习后可以快速高效解决自己的各类上传需求。

课程内容大纲：

课时1：微生物基因组上传NCBI必学要点

（1）细菌、真菌、质粒、病毒等，上传方法有什么异同？

（2）不同上传方式的区别与差异；

（3）上传过程中常遇到的问题和解决方案；

（4）上传流程和材料准备

（5）经验分享和建议

课时2：实操-基因组数据上传NCBI数据库

（1）基因组数据上传格式要求（细菌扫描图和完成图）

（2）单个基因组数据上传实操演示

（3）多个基因组数据批量上传实操演示

课时3：实操-原始数据上传SRA数据库

（1）原始数据上传格式要求

（2）原始数据上传实操演示

（3）提交后的状态查看

课时4：菌种鉴定结果上传到NCBI数据库

（1）原核生物和真核生物rRNA提交要求

（2）NCBI数据库在线比对方法

（3）一代测序数据上传实操演示